專訪︱基因組中心冀擴容收集50萬人數據 初生病嬰經基因測序揪出因由終免換肝

2024-06-11 06:00

專訪︱基因組中心冀擴容收集50萬人數據 初生病嬰經基因測序揪出因由終免換肝
專訪︱基因組中心冀擴容收集50萬人數據 初生病嬰經基因測序揪出因由終免換肝

人體內有超過30億個DNA代碼,當中只需有1個基因出現致病變異,便可誘發難解病症。有見及此,港府在2021年中啟動香港基因組計劃,撥款12億元冀在明年內為4至5萬人進行全基因組測序,以建立華南地區人口的基因組數據庫,助病人及早揪出病因。香港基因組中心指,截至上月已搜集3萬人數據,當中有初生嬰兒經基因測序證病情可觀察,免卻換肝之苦。中心期望,日後可將數據庫擴容至50萬人,以增強國際競爭力;且除罕見病外,亦能兼顧常見疾病的基因分析。

耗資7億建立本土數據庫

香港基因組中心運作將滿3年,其行政總裁羅思偉透露目前已花7億元撥款,有信心在預算內搜集4至5萬人數據,以建立香港「本土數據庫」。他指,目前與醫管局轄下7間醫院合作,經醫生招募患有未能確診病症、遺傳相關癌症,與及基因組學和精準醫學有關患者及親屬,進行全基因測序,以盡快揪出病因,進行個人化治療及跟進,未來冀做到「個人化預防」。他指,中心能在48小時內完成48個測序,每個樣本成本約1000美元,隨技術進步料「越來越平」,「海外數據庫以白人人口為主,若本港數據庫完善,有助藥廠開發針對華人藥物。參照海外經驗,要具備國際競爭力最少需16至20萬人數據,最好做到50萬人數據。」

香港基因組計劃目標在明年內搜集4至5萬人數據,未來更擬擴大至50萬人。(歐樂年攝)
香港基因組計劃目標在明年內搜集4至5萬人數據,未來更擬擴大至50萬人。(歐樂年攝)
香港基因組中心行政總裁羅思偉笑言,未來5年工作亦是繼續「擴大數據庫」。(歐樂年攝)
香港基因組中心行政總裁羅思偉笑言,未來5年工作亦是繼續「擴大數據庫」。(歐樂年攝)
計劃處理數據均會去識別化,抹去病人姓名、性別、出生日期等資料,僅留代號作識別。(歐樂年攝)
計劃處理數據均會去識別化,抹去病人姓名、性別、出生日期等資料,僅留代號作識別。(歐樂年攝)
病人樣本抵達後,科研人員會在監控鏡頭下解鎖樣本箱,並以單向流程運送,避免出現污染。(歐樂年攝)
病人樣本抵達後,科研人員會在監控鏡頭下解鎖樣本箱,並以單向流程運送,避免出現污染。(歐樂年攝)
左起:香港基因組中心行政總裁羅思偉、中心首席醫務及科學總監鐘侃言、營運主管(生物信息事務)于浩聰。
左起:香港基因組中心行政總裁羅思偉、中心首席醫務及科學總監鐘侃言、營運主管(生物信息事務)于浩聰。

中心首席醫務及科學總監鍾侃言指,每次測序一般可找出400萬個基因變異,需以大數據逐一對照,才能找出1個可能致病的變異。他說:「以肝癌為例,會同時抽取腫瘤及血液樣本,對比當中基因,加快揪出致病部份;若是心臟出問題者,會集中對比與心臟結構相關基因。」他指,目前3萬人樣本大部分來自患者,「兒科病人的父母多數亦會提供樣本,以確認孩子病因是遺傳性抑或基因突變;若是基因突變,較少影響下一胎,可左右其生育決定。」

覆蓋將兼顧罕見病常見病 

目前樣本中,癌症患者約佔10%,基因組學和精準醫學個案亦不斷增長。鍾侃言指:「精準醫學範疇闊,如骨質疏鬆亦與基因相關;另正與心臟、腦科及腎科等專家探討,基因測序可幫到哪些病人。」對糖尿病等慢性病日後會否納入計劃,鍾冀不論罕見疾病,抑或是常見疾病均「兼顧得到」。

計劃亦幫助不少病人。有初生嬰兒因持續肝功能異常,進行膽管閉塞手術後亦未見好轉,本已計劃換肝,幸經快速基因測序,找出JAG1基因變異,確診患「阿拉吉歐症候群」(兒童肝病)。鍾侃言指:「兒童肝病患者約8成可不藥而癒,該患者經一般時間觀察後,病情亦好轉至不用換肝。」

中年人雙腿無力 確診漸凍人症

另外,有中年患者2邊小腿接連無力,且有腰椎側彎、脊椎關節退化,最終通過測序證有SOD1基因變異,確診肌萎縮性側索硬化症(漸凍人症),鍾指:「漸凍人症與10多個基因變異相關,而SOD1變異在港反覆出現,反映有本土性;過往有文獻指香港離島有患者數代有SOD1變異。因有專門mRNA藥物可針對SOD1緩減退化,故基因測序有助對症下藥。」另有中年盲腸癌患者,經測序證患林奇綜合症,日後有結腸及直腸癌等癌症風險亦高,可加密檢查以作預防。

醫管局指,現時轉介至基因組中心個案包括神經外科、臨床腫瘤科、精神科等病人;另今年起設遺傳輔導員和生物信息學家的專職醫療職系,以協助處理及支援病人和家屬。

記者 脫芷晴

香港基因組計劃:

項目 詳情
成功招募 逾3萬人
總數據量 近4000TB
篩查成本 每個樣本約1000美元(現時參與者免費)
篩查範圍 1. 未能確診病症
  2. 與遺傳相關癌症
  3. 基因組學及精準醫學相關個案,如骨質疏鬆
*截至今年5月 資料來源:綜合受訪者

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